| R | Mannschaft | Sp | S | U | N | Tore | TD | P |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. | Hertha BSC | 34 | 23 | 5 | 6 | 6928 | 41 | 74 |
| 2. | FC Augsburg | 34 | 19 | 8 | 7 | 5827 | 31 | 65 |
| 3. | VfL Bochum 1848 | 34 | 20 | 5 | 9 | 4935 | 14 | 65 |
| 4. | SpVgg Greuther Fürth | 34 | 17 | 10 | 7 | 4727 | 20 | 61 |
| 5. | FC Erzgebirge Aue | 34 | 16 | 8 | 10 | 4037 | 3 | 56 |
| 6. | FC Energie Cottbus | 34 | 16 | 7 | 11 | 6552 | 13 | 55 |
| 7. | Fortuna Düsseldorf 1895 | 34 | 16 | 5 | 13 | 4939 | 10 | 53 |
| 8. | MSV Duisburg | 34 | 15 | 7 | 12 | 5338 | 15 | 52 |
| 9. | TSV 1860 München2 Punkte Abzug wegen Verstoßes gegen die Lizenzierungsordnung | 34 | 14 | 10 | 10 | 5036 | 14 | 50 |
| 10. | TSV Alemannia Aachen | 34 | 13 | 9 | 12 | 5860 | -2 | 48 |
| 11. | 1. FC Union Berlin | 34 | 11 | 9 | 14 | 3945 | -6 | 42 |
| 12. | SC Paderborn 07 | 34 | 10 | 9 | 15 | 3247 | -15 | 39 |
| 13. | FSV Frankfurt 1899 | 34 | 11 | 5 | 18 | 4254 | -12 | 38 |
| 14. | FC Ingolstadt 04 | 34 | 9 | 10 | 15 | 4046 | -6 | 37 |
| 15. | Karlsruher SC | 34 | 8 | 9 | 17 | 4672 | -26 | 33 |
| 16. | VfL Osnabrück | 34 | 8 | 7 | 19 | 4062 | -22 | 31 |
| 17. | SC Rot-Weiß Oberhausen | 34 | 7 | 7 | 20 | 3065 | -35 | 28 |
| 18. | DSC Arminia Bielefeld3 Punkte Abzug wegen Inanspruchnahme des DFL-Sicherungsfonds | 34 | 4 | 8 | 22 | 2865 | -37 | 17 |